ด้านความปลอดภัยของอุปกรณ์ก็สำคัญไม่แพ้กัน เพราะไฟล์ PDF สามารถฝังสคริปต์หรือช่องโหว่ที่เปิดทางให้แฮกเกอร์ได้ ฉันมักสแกนไฟล์ก่อนเปิด ใช้โปรแกรมอ่าน PDF ที่ปิดการรันจาวาสคริปต์ และถ้าเป็นไปได้จะเปิดในเครื่องเสมือนหรืออุปกรณ์ที่ไม่ค่อยมีข้อมูลสำคัญอยู่ ไฟล์ที่ถูกล็อกด้วยรหัสผ่านหรือบีบอัดมาพร้อมกับคำขอให้ป้อนข้อมูลส่วนตัวก็เป็นสัญญาณเตือน