フェデリコ2世の治世で特筆すべきは第六回十字軍の巧みな外交解決だ。武力衝突を避けながらエルサレムの支配権を獲得した手腕は、当時のキリスト教世界に衝撃を与えた。
彼がアラブ文化への深い理解を示したことも、中世ヨーロッパにおける異文化交流の先駆的な例となった。シチリア王国で発展させた多文化共生体制は、後のルネサンス思潮の萌芽と評されることもある。
特異なのは、彼が科学的探求を奨励した点で、鷹狩りに関する学術書『De Arte Venandi cum Avibus』は、現代の動物行動学の先駆けとすら言える内容を含んでいる。