小さなパン屋さんの人気の秘密は何だと思いますか？

星のない夜にだけ開くパン屋がある。 ほしのベーカリー、そこは人生に迷った人しか辿り着くことのできないパン屋。 なんでも、店主はその人の人生にあったものを焼いてくれるのだとか。 これは、夜の星が見守る、小さな奇跡の物語。

家業パン屋さんで働くメルは、パンが大好き。 いきなり聖女召喚の儀やらで異世界に呼ばれちゃったのに「いらない」と言われて追い出されてしまう。どうすればいいか分からなかったとき、公爵家当主に拾われ公爵家にお世話になる。 衣食住は確保できたって思ったのに、パンが美味しくないしめちゃくちゃ硬い！！ パン好きなメルは、厨房を使いふわふわパン作りを始める。

主人公はスイーツが大好きなヒロイン、由紀乃。ある日由紀乃は、冷凍食品を扱う会社【スリーデイズ】で副社長を務める天野川大翔と出会う。 大翔からスリーデイズが新たにスイーツ部門を立ち上げることを聞かされた由紀乃は、大翔からスイーツ部門の開発メンバーとして立ち上げに協力してほしいとお願いされる。 その報酬は一億円で、一億円で大翔と結婚してほしいとお願いされた由紀乃は、戸惑いながらも結婚することを決める。スリーデイズのスイーツ部門のメンバーとしてスイーツ開発が始まる。 スリーデイズが最初に開発するスイーツを決めることになった由紀乃たちだったが、意見を出し合う中、スイーツ開発にアップルパイが決定する。

26歳のＯＬ・一ノ瀬由衣は３歳年上イケメンの先輩・藤川幸樹と付き合ってもいて、周りから見れば公私ともに充実しているが、実は交際を始めてからずっと、幸樹からのＤＶと束縛に悩んでいたのだ。 そんな彼女の隣の部屋に、ある日幼なじみで現在はコックの秋本直也が引っ越してくる。 子供のころから由衣のことを気にかけていた彼は、彼女がＤＶ被害者であることを見抜き、「毎朝一緒に朝食を食べながら、前の日にあったイヤなことを俺に話してほしい」と提案し、彼女に相談窓口やＮＰＯ法人などを紹介する。 「あたしは一人じゃない」――。直也という強い味方ができたことで、由衣は明るさを取り戻していく。そして、自分もまた直也に惹かれていることに気づくが……。

私の家は餅専門店を営んでいる。値段は法外なのに、女性客が絶えない。ある日、姉が製法を盗もうとしたところを母に見つかってしまった。その時、私は知ることになった。うちの餅の原料は、なんと男だったのだ。この世に悪い男がいる限り、材料は尽きることはない。そして、母がこの店を開いた本当の理由は、亡くなった祖父母のためだった。実は、祖父母を死に追いやったのは姉だったのだ。それ以来、母はこの世の悪人たちに恨みを抱き続けていたのだった。

恋人に別れを告げられた橋本奈央は商店街にある喫茶「ベゴニア」のコーヒーに心を奪われた。精神安定剤とも言えるコーヒーを淹れる桐山水樹は恐ろしく美しい青年で、人間観察と称して通うことになる。私だけが取り残されるように時が流れ、いつの間にか街全体はクリスマス一色。後押しされるように２人の距離が一気に縮まっていく。