ความแตกต่างแรกที่สังเกตได้ชัดระหว่าง '
มังกรกัณฐ์' ในรูปแบบนวนิยายกับอนิเมะคือรายละเอียดของโลกที่สร้างขึ้น นวนิยายให้อรรถรสทางภาษาที่ลึกซึ้งกว่า โดยเฉพาะการบรรยายจิตใจตัวละครและภูมิหลังของจักรวาลที่ซับซ้อน ในขณะที่อนิเมะต้องย่อเนื้อหาเพื่อให้เหมาะกับเวลาจำกัด
อีกจุดที่ต่างคือจังหวะการเล่าเรื่อง อนิเมะมักเร่งรีบเพื่อดึงดูดผู้ชมด้วยแอ็กชัน ส่วนนวนิยายค่อยๆ สานเรื่องราวอย่างมีชั้นเชิง บางฉากที่อ่านแล้วสั่นไหวในหนังสือ อาจถูกตัดออกหรือปรับเปลี่ยนในเวอร์ชันอนิเมะเพื่อให้เข้ากับจังหวะการผลิต