Dalam dunia pewayangan Jawa, ada banyak ajaran filosofis yang tersirat, dan 'Ilmu Sastra Jendra Hayuningrat Pangruwating Diyu' memang sering dikaitkan dengan cerita wayang, meski tidak secara eksplisit disebut dalam setiap lakon. Konon, ilmu ini merupakan rahasia tertinggi yang mengajarkan tentang penyucian diri dari sifat-sifat kebinatangan (diyu). Tokoh seperti Semar atau Begawan Abiyasa sering dianggap sebagai simbol dari pengetahuan ini—mereka yang mampu menuntun manusia menuju kesempurnaan.
Dalam 'Serat Centhini', misalnya, ada pembahasan tentang ilmu-ilmu gaib dan spiritual Jawa yang mirip dengan konsep Sastra Jendra. Wayang sendiri sebenarnya adalah medium untuk menyampaikan ajaran moral, jadi meski nama ilmunya tidak selalu disebut, esensinya ada dalam banyak kisah. Misalnya, ketika Arjuna bertapa atau Werkudara mengendalikan amarahnya, itu bisa dilihat sebagai penerapan 'pangruwating diyu'—proses mengolah watak.